根據《廈門市科學技術獎勵辦法》規定，經市科學技術獎勵委員會評審通過，我院院長、眼表專科劉祖國主任醫師、眼表專科副主任醫師李煒在《眼表上皮疾病的基礎與臨床研究》中獲得2009年廈門市科技進步獎一等獎。我院行政院院長李曉峰、眼表及角膜專科吳護平、謝素貞、董諾、劉昭升、閆蕾、白瓊珍的《治療性角膜移植手術臨床應用的系列研究》被授予2009年廈門市科學技術進步獎三等獎。

另外，我院還獲得中共廈門市委、廈門市人民政府授予的“廈門市留學人員工作先進工作單位”榮譽稱號，劉祖國院長被授予“廈門市優秀留學回國人員”的榮譽稱號。